En 2009/10 el FC Bayern contrató a Louis van Gaal como técnico. Arjen Robben llegó procedente del Real Madrid.
Los primeros diez años del milenio fueron testigo de una serie de éxitos sin parangón en el club, tanto dentro como fuera del terreno de juego.
Los años 90 fueron una década de agitación constante.
Tras una sequía doméstica de cinco años, el gerente general Hoeneß y los jugadores Breitner y Rummenigge llevaron al Bayern de vuelta a la senda del éxito.
Una exitosa campaña en la primera temporada de Bundesliga del club en la 1965/66 sirvió para obtener la tercera plaza.
El FC Bayern se establece como uno de los grandes clubes de Alemania.
La historia comienza con Franz John, de Berlín