Die Schachabteilung entstand 1980 durch Integration des Schachclubs Anderssen Bavaria in den FC Bayern München e.V. und hat seit ihrem Bestehen zahlreiche Erfolge gefeiert. Hierzu zählen Titelgewinne auf deutscher Ebene, bayerischer Ebene und Münchner Ebene sowohl in Mannschafts- als auch in Einzelwettbewerben.
Mannschaftsmeisterschaften
Europapokal:
1992
Deutscher Mannschaftsmeister (1. Bundesliga):
1983, 1985, 1986, 1989, 1990, 1991, 1992, 1993, 1995
Deutscher Blitz-Mannschaftsmeister:
1984, 1985, 1987, 1988, 1989, 1990, 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 2011, 2015